Институт обладает значительным кадровым потенциалом для успешного осуществления научно-технической деятельности. Сегодня в АО «НИИАС» трудится более 100 человек, имеющих ученые степени, в том числе 22 доктора наук, 87 кандидатов наук, один академик РАН. Молодые ученые неоднократно становились победителями отраслевых научно-практических конкурсов и обладателями грантов на проведение научных исследований в сфере железнодорожного транспорта.
В АО «НИИАС» функционирует деcять НТК, пять специализированных центров и четыре филиала. Их работа ориентирована на решение важнейших научно-практических задач в ряде стратегических направлений развития железнодорожного транспорта. Приоритетным в работе подразделений является комплексный подход в создании и внедрении систем управления всеми циклами производственного процесса на железнодорожном транспорте.